Durante a Ditadura Militar existiram campos de concentração indígenas. Para lá foram levados mais de cem indivíduos de diversos povos indígenas, oriundos de ao menos 11 estados das cinco regiões do país. Existiram denúncias de torturas, trabalho escravo, desaparecimentos e intensa repressão cultural. O Museu apresenta um vídeo com o depoimento de João Batista de Oliveira, Krenak da Terra indígena Vanuíre, que ficou preso nesse período no reformatório Krenak em Resplendor – Minas Gerais.